TV CARTOON Alvin and the chipmunks: chipwrecked mengisahkan tentang petualangan lanjutan dari trio tupai yang tergabung dalam the chipmunks; alvin (justin long), simon (matthew gray gubler), dan theodore (jesse mccartney).
Kisah berawal dari dave (jason lee), yang mengajak the chipmunks dan chipettes; brittany (christina applegate), jeanette (anna faris), dan eleanor (amy poehler), berlibur dengan menaiki sebuah kapal pesiar. Namun di sana, chipmunks dan chipettes malah membuat masalah. Dave kemudian menyadari bahwa mantan atasannya, ian hawke (david cross), kini bekerja sebagai pengawas keselamatan kapal. Ian menginformasikan kepada kapten kapal bahwa chipmunks dan chipettes adalah sumber dari masalah yang terjadi di kapal. Alvin kemudian mencoba parasailing menggunakan sebuah layang-layang, namun layang-layang tersebut justru terbang membawanya bersama chipmunks yang lain. Dave pun mencoba mengejar mereka dengan menggunakan gantolle, namun disaat ian menghentikannya, keduanya terdampar di laut pasifik.
Namun saat simone dan jeanette tengah mencari makanan, simone dibuat pingsan oleh seseorang dan jeanette diculik. Simon kembali kepada kepribadiannya, namun ia tak sadar tentang kejadian sebelumnya, saat ia tergigit laba-laba.
Rupanya, zoe-lah yang menculik jeanette agar dapat mengambilkan emas yang ditemukan simone sebelumnya di dekat air terjun. Mereka pun segera pergi ke air terjun untuk menyelamatkan jeanette, hingga akhirnya jeanette dapat diselamatkan, dan zoe pun tersadarkan dan meminta maaf pada jeanette dan yang lainnya. Mereka akhirnya keluar dari pulau tepat waktu sebelum terjadi letusan gunung. Kisah berakhir dengan chipmunks dan chipettes yang tampil di international music awards, dan ian kini menjadi seorang penulis naskah di hollywood yang menuliskan kisah asli zoe.
